Lycéen d'une intelligence hors norme, Brendan Frye est un garçon solitaire qui préfère se tenir à l'écart de ses camarades. Jusqu'au jour où son ex-petite amie, Emily, tente de reprendre contact avec lui, avant de disparaître. Toujours amoureux d'elle, Brendan se met en tête de la retrouver... Pour mener ses investigations, il sollicite l'aide du «Cerveau», le seul garçon de son âge en qui il ait confiance, et tient l'assistant proviseur adjoint informé du progrès de ses recherches.