Sheppard et son équipe sont de retour à Atlantis en possession du vaisseau ruche Wraith dont ils se sont emparés pour s'échapper. Le Dr Weir félicite son équipe pour son succès dans la lutte contre les Wraith et leur présente Richard Woolsey qui l'a accompagnée pour l'évaluer dans son travail à la tête de l'expédition. Reste maintenant à déterminer le sort des 200 Wraith qui ont été capturés et humanisés par l'équipe du docteur Beckett.