À la demande de la mère supérieure du lycée Saint-Francis, situé dans un quartier difficile de San Francisco, Deloris Van Cartier endosse une nouvelle fois la soutane pour porter secours à un établissement que Monsieur Crisp, un homme d'affaires sans scrupules, a menacé de fermeture. Elle reprend donc l'identité de soeur Marie-Clarence et prépare, en tant que professeur de musique, sa classe de rappeurs au grand concours de chorale de Californie, espérant ainsi remporter le prix qui permettra de sauver l'école.