Scooby et sa bande se rendent dans un cirque itinérant où un mystérieux loup-garou sème la panique parmi les artistes et les spectateurs... La fine équipe se charge d'enquêter sur cette étrange affaire. Ils se font alors engager dans le cirque afin de mener leur investigation «sous couverture». Pour l'occasion, Fred se découvre des talents d'acrobate, Sammy et Scooby sont dresseurs d'animaux, Vera est la femme canon et Daphné doit assurer un numéro de clown.