Noé reçoit un message de Dieu lui prédisant l'Apocalypse. Un déluge va s'abattre sur la Terre dans le but d'éradiquer la méchanceté du monde. Sur les conseils de son grand-père, Mathusalem, Noé entreprend dès lors la construction d'un vaisseau monumental grâce auquel il pourra sauver les innocents et préserver la vie. À bord de cette arche, il embarquera sa famille ainsi que toutes les espèces d'animaux vivants. Mais cette entreprise n'est pas du goût de Tubal-Caïn, un seigneur de la guerre qui prétend être le roi de la Terre et décide de lever une armée pour lui barrer la route.