Le capitaine Tanner est kidnappé en plein jour sous les yeux de son fils de six ans qui prévient immédiatement le NCIS. Tanner travaillait sur un projet secret-défense nommé Honneur dont lui seul possédait les codes de protection. Pendant que Gibbs se prend d'affection pour le garçon surdoué, son équipe découvre que le projet honneur est piraté, menaçant ainsi la sécurité du pays. Et au fur et à mesure de l'enquête, Tanner incarne de moins en moins le profil de la victime.