Après avoir été infiltrée par l'association criminelle Kaos, dirigée par le terrible Siegfried, l'agence de renseignement américaine Control doit se passer des services de la totalité de ses agents, dont l'identité a été compromise. Dos au mur, l'agence se voit contrainte de donner une promotion au premier venu, en l'occurrence Maxwell Smart, un analyste ayant toujours rêvé de devenir agent secret, mais dont les ambitions ont longtemps été freinées par une maladresse chronique. Max se retrouve lancé en pleine mission - consistant purement et simplement à sauver le monde - avec pour partenaire la belle et redoutable agent 99