Boog et Elliot sont de retour. Tombé follement amoureux de Giselle, Elliot voit sa route prendre un détour inattendu lorsque Weenie, un chien échappé de sa maison, est kidnappé par un groupe d'animaux domestiques qui veulent le rendre à ses propriétaires. Boog, Elliot, McSquizzy, Buddy et le reste des habitants de la forêt organisent une grande opération de sauvetage pour aider leur ami teckel à retrouver la liberté. C'est ainsi que les hôtes de la forêt se retrouvent au beau milieu du territoire de leurs ennemis, les animaux domestiques, dirigés par le caniche Fifi. La confrontation entre les deux clans est inévitable et tourne à la guerre.