Languedoc, au XIIème siècle. Après la mort -sur un bûcher de l'Inquisition- de son père, traducteur du penseur arabo-andalou Averroès, le jeune Joseph rejoint à Cordoue les disciples du sage, qui prône la tolérance, la joie de vivre et d'apprendre, et enseigne aussi bien la philosophie, le droit, les sciences et la médecine qu'une théologie sans fanatisme. Parmi ses élèves se trouvent les deux fils et le frère du calife El Mansour. Ce dernier oscille entre autoritarisme et libéralisme, et Averroès est son conseiller. Les milieux religieux conservateurs n'admettent pas la liberté de comportement du philosophe et s'attaque également à ses amis.