Des générations après le règne de César, un virus a transformé le monde : les singes ont acquis parole et intelligence, alors que les humains en ont été privés. Noa, un jeune chimpanzé du clan des Oiseaux, croise la route d'une «Echo», l'une des dernières humaines. Poursuivie par le clan Proximus, un clan de bonobos violents, la jeune femme entraîne malgré elle Noa et les siens dans un affrontement brutal.