McGarrett se fait subtiliser la boîte à outils de son père, contenant tous les éléments de son enquête sur le meurtre de sa femme. Steve parvient ensuite à délivrer sa soeur d'un kidnapping, alors qu'elle enquêtait de son côté sur sa mère. L'unité remonte jusqu'à un puissant homme d'affaires japonais, une connaissance du gouverneur Jameson.