Alors que Jenkins s'apprête à joindre Flynn Carson et Eve Baird pour l'éternité lors d'une cérémonie qui les liera à la Bibliothèque, une alarme les informe qu'une des pierres angulaires de la Grande Bibliothèque d'Alexandrie a été volée. Or, la destruction de ce joyau antique est à l'origine de la Bibliothèque Magique et si les pierres sont réunies, celle-ci sera de nouveau vulnérable et risque d'être détruite à son tour. Le forfait est l'oeuvre d'un ordre de prêtres renégats qui veulent favoriser le retour à l'Obscurantisme. Flynn et les nouveaux aventuriers doivent retrouver les pierres restantes avant l'Ordre des Ombres, mais ne disposent d'aucun élément de piste.